威胁一：海洋环境污染日益加剧。
海洋环境污染日益加剧是海洋生物多样性面临的最主要威胁之一。海洋环境污染，使得海水和沉积物中的营养盐和重金属等化学因子含量发生改变，对海洋生物的正常栖息、觅食、繁衍、生存等造成影响。
威胁二：海洋资源过度开采。
过度开采，包括过度捕捞，盲目围填海，不合理的工业布局和滨海旅游资源不合理开发利用等，是造成海洋生物多样性下降的不可忽视的原因。
威胁三：海洋物种生境遭到破坏。
在沿海社会经济高速发展的带动下，海洋海岸带开发活动和城市扩张建设日益增多，不合理的开发直接或间接造成了自然岸线变异、海岸侵蚀加重、海洋环境污染、富营养化加剧，典型海洋生态系统和重要栖息地不断丧失，海洋生物群落结构发生重大改变，优质海洋生物资源衰竭，海洋生物多样性持续下降等。
